15世纪末，葡萄牙殖民主义者侵入几内亚湾沿海地区和比奥科、科里斯科和安诺本等岛。1778年西班牙占领比奥 科岛，1843年占领木尼河地区，1845年建立殖民统治。1959年被划为西班牙的两个海外省。1963年12月西当局在赤道几内亚举行公民投票，通过“内部自治”法规。1964年1月实行“内部自治”。马西埃·恩圭马任总统。1979年8月国家革命人民武装力量部副部长奥比昂发动军事政变，成立以他为首的最高军事委员会。1982年8月奥比昂任总统，同年10月解散军委会。1988年在全国范围内进行了基层政权选举和议会换届选举。1989年6月25日举行全国大选，奥比昂再次当选为总统。1996年2月连任总统。

1991年开始开发石油后，经济出现转机。1996年提出以农业为基础、石油为重点，促进木材加工工业发展的经济政策。1997年制定《经济中期发展战略》（1997－2001年），并采取了增加信贷投放量，提高可可收购价格，降低生产资料零售价格等一系列刺激经济发展的措施，经济保持快速增长。

1997至2001年经济年均增长率达41.6%。2002年，赤几政府努力促进经济多元化发展，大力推行粮食安全特别计划，加大基础设施建设力度，在石油开发和基础设施建设的拉动下，经济继续保持快速增长的良好势头。

由于石油工业的快速发展，工业总产值在国内生产总值中所占的比重逐年增加，2001年达91.2%。但结构单一，其它工业部门较落后。2002年日产原油达25.8万桶。在赤几开采石油的主要是美孚、埃尔夫等美、法石油公司。根据协议，赤几政府以原油偿还上述石油公司的投资。石油公司则向赤几政府支付一定比例的石油收入，作为用地费用和税款。赤几政府为获得更大份额同美孚石油公司就修改协议多次举行谈判并取得初步进展。1998年12月，议会批准了新的《石油开采法》，赤几方获得的石油份额将从过去的10%增加到13%~20%。为加强对石油勘探、开采等工作的管理，1999年8月，赤几政府决定成立石油开采工作跟踪委员会，并宣布将今后所有石油收入纳入国家财政预算；石油勘探、开采协议和合同一律由经济财政部签署后交总统批准。2001年，成立国家石油公司。2002年，政府投资4.15亿美元建设的甲醇基地落成，日产甲醇2500桶，年产达92.5万吨。全国有十几个中、小型水电站和热电厂，多为外国援建，最大装机容量为3956千瓦。现有20余家外国伐木公司。