1914年第一次世界大战爆发以后，慕尼黑的生活变得非常困难。盟国封锁德国，造成食品和燃料严重短缺。第一次世界大战结束后，慕尼黑成为政治动荡的中心。

1918年11月革命前夕，路德维希三世 (巴伐利亚)全家逃离慕尼黑。1919年2月，巴伐利亚共和国首任总理库尔特·艾斯纳（Kurt Eisner）被右翼组织图利协会（Thule Gesellschaft）的一名成员Anton Graf von Arco-Valley刺杀身亡（见刀刺在背传说），这时共产党夺取政权，成立了巴伐利亚苏维埃共和国（Bayerische Räterepublik or Münchner Räterepublik）。

1919年5月3日，苏维埃共和国被自由军团采用血腥手段镇压下去，共和国政府恢复，慕尼黑随后成为右翼政治的温床。

1923年，希特勒和他的支持者（当时都集中在慕尼黑）发动了“啤酒馆政变”，率冲锋队逮捕了当地的长官，企图推翻魏玛共和国，夺取政权。

1933年，纳粹党在德国掌权后，慕尼黑再度成为纳粹据点。纳粹在慕尼黑西北16公里处的达豪建立了第一个集中营。由于慕尼黑是纳粹兴起的发祥地，纳粹将该市称为“运动首都”（Hauptstadt der Bewegung）。纳粹党总部设在慕尼黑，国王广场附近建有许多领袖建筑（Führerbauten），其中一部分保存了下来。

1938年9月，第二次世界大战爆发前一年，德国、意大利、英国和法国四国首脑希特勒、墨索里尼、张伯伦、达拉第在该市签署了《慕尼黑协定》。

第二次世界大战期间，慕尼黑曾经先后遭到盟军的71次空袭，市区建筑四分之一以上受到破坏，许多地方被夷为平地。