圣彼得堡是俄罗斯第二大交通枢纽，多条铁路干线在此交汇，拥有俄罗斯最大的海港，也是重要的国际航空港。11条航线同国内200多个城市以及20多个国家通航。

航空

圣彼得堡是重要的国际航空港，是俄罗斯西北地区最大的空港。圣彼得堡的空中门户是普尔科沃机场，该机场占地15平方公里，有两条跑道，可起降世界上最大的飞机，同前苏联境内的200多个城市以及国外的17个国家通航。机场离市区20公里，分为国内航班候机楼和国际航班候机楼，分别叫作普尔科沃1号和2号。

从机场出来坐出租到市内一般价格是20-30美元，但停在机场停车场的出租车统一要价是50美元，可以砍价到40美元。另外有公交专线车（相当于中国民航大巴）直达机场，费用为5卢布。

铁路

圣彼得堡是俄罗斯西北区的铁路枢纽，以圣市为基地的“俄罗斯铁路股份公司”、“十月铁路局”负责境内的铁路运输和向欧洲的进出境客货运输。全局经营运输线路超过1万公里，有10多万职工。

圣彼得堡有12条铁路干线呈放射状分别通向赫尔辛基、华沙、莫斯科及俄罗斯其他大城市。市内共有5个方向、6座始发客运火车站，分别是通往莫斯科方向的“莫斯科火车站”，通往波罗的海三国方向的“波罗的海火车站”和“华沙火车站”，通往白俄罗斯方向的“维杰堡斯克火车站”，通往北方和芬兰的“芬兰火车站”以及“拉多加火车站”。

公路

圣彼得堡的长途客运分市郊长途、跨省长途和国际长途。乘长途汽车可抵达莫斯科和周边各州的市镇，乘国际长途可前往白俄罗斯、波罗的海三国，以及芬兰等欧洲国家。市郊长途和省际长途主要由国营“客运汽车公司”经营。参与国际长途客运经营的还有民营公司和旅游汽车公司。赫尔辛基与圣彼得堡相距只有400多公里，每日均有频密的长途巴士来往两地。

水运

圣彼得堡是全国最大的海港，经水路可通往国内外广大地区。由北欧或东欧进入圣彼得堡都十分方便，北欧还可以选择乘坐油轮。

圣市内河运输主要通过伏尔加－波罗的海水道，涅瓦河是水道的重要组成部分。来自俄罗斯中部和东北部的货物主要通过这条水道运输。运送的货物有石油和石油制品、金属、木材、建材和化工品。因冬季冰冻限制，这条水道每年只有6个月左右的航运期。

地铁

圣彼得堡有5条地铁线，地铁站一般都设在商店的低层或十字街头的地下人行道里，有的就直接与火车站的地下通道相连，而且每个地铁出口都设有各种公交车站。地铁在白天一般2至3分钟一班，晚上5分钟一班。而在上下班高峰时20秒就有一列车进站。