早期为亚马孙地区热带林产品集散地，发展缓慢。19世纪末橡胶加工技术的发展和20世纪初汽车工业对轮胎的需求，使它迅速成为繁荣的野生橡胶贸易中心。1915年后因东南亚天然橡胶的竞争而突然衰落，人口大减。

第二次世界大战后，随着亚马孙地区热带资源的开发和石油的发现，加之1957年自由贸易区的设立，又逐渐恢复生气,人口由1940年的6.8万增加到1966年的21万。1967年设立自由港，鼓励国内外资本建设工商企业和农场，遂发展成为现代化的港口城市。工业主要有石油提炼、电子、摩托车、木材加工、橡胶、制革、黄麻、食品等。输出橡胶、巴西坚果、硬木、柯拜巴油、可可、鱼干以及电子产品和黄麻制品。旅游业日益发展，设有国际机场。市内有国立亚马孙河研究所、亚马孙大学。

马瑙斯自由贸易区面积共1万平方公里，以马瑙斯市为中心，由工业区、商业区和农牧区三部分组成。

工业区最初划定的地理面积是1700公顷（现已全部利用），随着当地投资建厂的增多，后又扩展了2200公顷（可供使用），主要由5大部门组成：电子工业、信息产业、两轮车工业、化工行业和热塑材料行业。

2005年，马瑙斯自由贸易区工业区创多项历史记录。工业区企业总营业额达189.6亿美元，进口原材料47.6亿美元，出口总值达20.2亿美元，税收93亿雷亚尔，约计40亿美元。直接就业人数达10.04万。另外，工业区产品2005年的国产化率超过50%，所在地区提供的原材料在总原材料中占比达33%。尽管雷亚尔相对美元升值，有利于进口，但工业区凭借较强的产品竞争力取得了替代进口的效果。